En fait, je l’ignorais, mais j’utilisais wayland.
La solution m’est parvenue dans un autre fil, via un autre utilisateur :
C’est ce que j’ai fait, et j’ai retrouvé mes marques, des logiciels manquants, etc. Pour le clic droit, j’ai tout simplement installé le gestionnaire de touchpad synaptics :
~$ sudo apt-get install xserver-xorg-input-synaptics
J’ai ensuite redémarré la session et tout fonctionnait.