Salut
ça devient le règle dans Debian 10 Buster:
https://www.debian.org/releases/buster/amd64/release-notes/ch-whats-new.fr.html#merged-usr
En cas de mise à niveau depuis Debian 9 Stretch
sudo apt install usrmerge
root@debian:~# ls -alrt /
total 80
drwxr-xr-x 2 root root 4096 janv. 24 2016 srv
drwxr-xr-x 2 root root 4096 janv. 24 2016 live-build
drwx------ 2 root root 16384 avril 5 2016 lost+found
drwxr-xr-x 4 root root 4096 avril 9 2016 media
drwxr-xr-x 3 root root 4096 sept. 20 2017 mnt
drwxr-xr-x 3 root root 4096 janv. 19 2018 Phoenix
drwxr-xr-x 11 root root 4096 juin 20 2018 var
-rw-r--r-- 1 root root 0 avril 24 08:45 0
drwxr-xr-x 7 root root 4096 juil. 23 13:46 home
lrwxrwxrwx 1 root root 26 juil. 27 10:13 vmlinuz -> boot/vmlinuz-5.2.3-xanmod4
lrwxrwxrwx 1 root root 29 juil. 27 10:13 initrd.img -> boot/initrd.img-5.2.3-xanmod4
lrwxrwxrwx 1 root root 27 juil. 27 11:23 vmlinuz.old -> boot/vmlinuz-4.19.0-5-amd64
lrwxrwxrwx 1 root root 30 juil. 27 11:23 initrd.img.old -> boot/initrd.img-4.19.0-5-amd64
drwxr-xr-x 3 root root 4096 août 5 11:24 boot
drwxr-xr-x 7 root root 4096 août 6 08:25 opt
drwx------ 35 root root 4096 août 6 18:30 root
dr-xr-xr-x 201 root root 0 août 6 20:03 proc
dr-xr-xr-x 13 root root 0 août 6 20:03 sys
drwxr-xr-x 21 root root 4700 août 6 20:04 dev
drwxr-xr-x 31 root root 880 août 6 20:31 run
drwxr-xr-x 15 root root 4096 août 6 20:32 usr
lrwxrwxrwx 1 root root 7 août 6 20:32 bin -> usr/bin
lrwxrwxrwx 1 root root 8 août 6 20:32 sbin -> usr/sbin
lrwxrwxrwx 1 root root 7 août 6 20:32 lib -> usr/lib
lrwxrwxrwx 1 root root 9 août 6 20:32 lib32 -> usr/lib32
lrwxrwxrwx 1 root root 10 août 6 20:32 libx32 -> usr/libx32
lrwxrwxrwx 1 root root 9 août 6 20:32 lib64 -> usr/lib64
drwxr-xr-x 20 root root 4096 août 6 20:32 ..
drwxr-xr-x 20 root root 4096 août 6 20:32 .
drwxr-xr-x 155 root root 12288 août 6 20:32 etc
drwxrwxrwt 13 root root 320 août 6 20:33 tmp
```