Bon, j’ai avancé un peu.
Déjà, pour Conky il fallait bien écrire “Conky” et non “conky”. Pour ceux qui en douteraient encore, Linux est sensible à la casse 
Par contre pour tint2, toujours rien à faire. Je pense que le problème vient de l’absence de WM_CLASS. Quand je fais un xprop sur tint2, il me renvoie :
seb@seb-desktop:~$ xprop
_ICEWM_TRAY(CARDINAL) = 0
_WIN_WORKSPACE(CARDINAL) = 0
WM_STATE(WM_STATE):
window state: Normal
icon window: 0x0
_WIN_STATE(CARDINAL) = 1, 63
_WIN_LAYER(CARDINAL) = 2
_MOTIF_WM_HINTS(_MOTIF_WM_HINTS) = 0x2, 0x0, 0x0, 0x0, 0x0
WM_HINTS(WM_HINTS):
Client accepts input or input focus: False
WM_NORMAL_HINTS(WM_SIZE_HINTS):
program specified location: -1078806024, -1220046860
_NET_WM_STATE(ATOM) = _NET_WM_STATE_SKIP_TASKBAR, _NET_WM_STATE_BELOW
_NET_WM_DESKTOP(CARDINAL) = 0
_NET_WM_STRUT_PARTIAL(CARDINAL) = 0, 0, 22, 0, 0, 0, 0, 0, 340, 1339, 0, 0
_NET_WM_STRUT(CARDINAL) = 0, 0, 22, 0
_NET_WM_WINDOW_TYPE(ATOM) = _NET_WM_WINDOW_TYPE_DOCK
_NET_WM_NAME(UTF8_STRING) = 0x74, 0x69, 0x6e, 0x74, 0x32
WM_NAME(STRING) = "tint2"
D’après la doc, il faut mentionner le WM_CLASS dans le winoptions, mais peut-on en assigner un à tint2 ? J’ai cru comprendre que les utilisateurs de tiling-WM avaient souvent à jouer avec ces WM_CLASS, vous avez peut-être des pistes ?