AMA, l’installation par paquet est une mauvaise idée, parcequ’il y a une cohabitation à configurer sous apache.
Tu devrais regarder sur le site de mediawiki comment ça s’installe “à la main”, quand on part des sources, et faire ta deuxiême install comme ça dans un autre repertoire de ton serveur apache que celui qu’installe le paquet debian.
Il y a peut être moyen de faire autrement pour partager entre les deux wikis les divers scripts php, et faire en sorte que les versions manuelles soit mises à jour en même temps que le paquet, mais il faudrait rentrer dans les finesses de déploiement de mediawiki.
Et aussi, peut etre que un seul mediawiki peut servir plusieurs wiki en fonction du nom par lequel on accede, je ne connais pas les fdonctionnalités de config.