Il est les deux. Vu “du dessus”, c’est un système de fichiers qu’on peut monter comme un autre avec mount. Vu “du dessous”, c’est un protocole réseau entre le client et le serveur.
Un système de fichiers n’est pas forcément une structure de données stockée sur un périphérique bloc à la ext2. Pour moi, c’est une abstraction qui présente une structure de répertoires et de fichiers à la couche du dessus (VFS) et peut s’appuyer sur n’importe quoi par dessous : périphérique bloc traditionnel (Ext2/3/4, ReiserFS, XFS, ISO9660, UDF…) bien sûr mais aussi système de fichiers distant (NFS, Samba) ou virtuel en mémoire (ramfs, tmpfs) voire variables du noyau (procfs, sysfs, usbfs…)