Tu peux MAJ ton bios tranquillement, je ne vois pas ce que ca peu poser comme prob sous debian si tu remet bien les memes paramettres.
Regler l’alimentation des ports usb ca n’est pas possible meme dans les bios a ma connaissance, donc je ne vois pas comment ca le serait sur debian.
Par contre une MAJ du bios semble pouvoir regler certains problemes d’alim USB. Je me rappel il y a quelques année avec un modem USB j’avait eu le probleme. Je me paye un nouveau PC, la nouvelle carte mere déconnaient avec les modem USB, j’ai du attendre qu’une MAJ du bios sorte 
Mais dans ton cas vue la facon dont ca arrive j’ai peur que ca ne vienne pas du bios, ma mésaventure datte d’au moins 5 ans… Peut etre du cable carte mere/facade qui serais de la camelotte ou les ports eux meme ou encore usure de ceux ci, les boitiers sont de plus en plus de mauvaise qualité.
Essaye sur les ports a l’arriere du PC… Si c’est pareil tente la MAJ du bios.